Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms