Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRDM7Q9NQW5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms