Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC8Q9H0W5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC8Q9H0W5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms