Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Smim3Q99PE5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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