Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms