Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms