Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CELF6Q96J87 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms