Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms