Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC21AQ8NDW8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC21AQ8NDW8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms