Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim35Q8C006 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim35Q8C006 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms