Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms