Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms