Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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