Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF1AQ15573 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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