Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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SCGB2A2Q13296 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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SCGB2A2Q13296 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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SCGB2A2Q13296 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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