Protein–RNA interactions for Protein: Q12330

SME1, Small nuclear ribonucleoprotein E, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SME1Q12330 NUT1YGL151W 3399 nt0.99□□□□□ -2.25
SME1Q12330 SEC3YER008C 4011 nt0.98□□□□□ -2.25
SME1Q12330 FIG2YCR089W 4830 nt0.98□□□□□ -2.25
SME1Q12330 EAF1YDR359C 2949 nt0.98□□□□□ -2.25
SME1Q12330 MPT5YGL178W 2580 nt0.98□□□□□ -2.25
SME1Q12330 YHL037CYHL037C 402 nt0.97□□□□□ -2.25
SME1Q12330 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.97□□□□□ -2.25
SME1Q12330 YOL159CYOL159C 516 nt0.97□□□□□ -2.25
SME1Q12330 APL3YBL037W 3078 nt0.97□□□□□ -2.25
SME1Q12330 SCW11YGL028C 1629 nt0.97□□□□□ -2.25
SME1Q12330 CDC39YCR093W 6327 nt0.96□□□□□ -2.26
SME1Q12330 RPL16AYIL133C 600 nt0.96□□□□□ -2.26
SME1Q12330 PHS1YJL097W 654 nt0.96□□□□□ -2.26
SME1Q12330 SDH2YLL041C 801 nt0.96□□□□□ -2.26
SME1Q12330 RUF22RUF22 515 nt0.96□□□□□ -2.26
SME1Q12330 STB6YKL072W 2301 nt0.96□□□□□ -2.26
SME1Q12330 APL1YJR005W 2103 nt0.95□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YLL032CYLL032C 2478 nt0.95□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.95□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.95□□□□□ -2.26
SME1Q12330 NBL1YHR199C-A 222 nt0.95□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YML108WYML108W 318 nt0.95□□□□□ -2.26
SME1Q12330 SAS3YBL052C 2496 nt0.95□□□□□ -2.26
SME1Q12330 RFX1YLR176C 2436 nt0.95□□□□□ -2.26
SME1Q12330 VAM6YDL077C 3150 nt0.94□□□□□ -2.26
SME1Q12330 MRPL31YKL138C 396 nt0.94□□□□□ -2.26
SME1Q12330 GAL7YBR018C 1101 nt0.94□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YPR153WYPR153W 423 nt0.94□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YLR422WYLR422W 5799 nt0.94□□□□□ -2.26
SME1Q12330 AIM44YPL158C 2277 nt0.93□□□□□ -2.26
SME1Q12330 NUP145YGL092W 3954 nt0.93□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.93□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YIL059CYIL059C 366 nt0.93□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.93□□□□□ -2.26
SME1Q12330 NFU1YKL040C 771 nt0.93□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YLR255CYLR255C 354 nt0.93□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YBL108WYBL108W 306 nt0.93□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.93□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.93□□□□□ -2.26
SME1Q12330 ENV11YGR071C 2583 nt0.92□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YDR269CYDR269C 324 nt0.92□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.92□□□□□ -2.26
SME1Q12330 UPS1YLR193C 528 nt0.92□□□□□ -2.26
SME1Q12330 CDC33YOL139C 642 nt0.92□□□□□ -2.26
SME1Q12330 APL2YKL135C 2181 nt0.91□□□□□ -2.26
SME1Q12330 FIG4YNL325C 2640 nt0.91□□□□□ -2.26
SME1Q12330 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.91□□□□□ -2.26
SME1Q12330 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.91□□□□□ -2.26
SME1Q12330 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
SME1Q12330 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.91□□□□□ -2.26
SME1Q12330 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YHR125WYHR125W 306 nt0.91□□□□□ -2.26
SME1Q12330 RPL34BYIL052C 366 nt0.91□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.91□□□□□ -2.26
SME1Q12330 AIM29YKR074W 468 nt0.91□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YBR012CYBR012C 420 nt0.91□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YPL182CYPL182C 384 nt0.91□□□□□ -2.26
SME1Q12330 SET3YKR029C 2256 nt0.91□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YJR029WYJR029W 5268 nt0.9□□□□□ -2.26
SME1Q12330 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.9□□□□□ -2.26
SME1Q12330 SLY1YDR189W 2001 nt0.9□□□□□ -2.27
SME1Q12330 CYC7YEL039C 342 nt0.9□□□□□ -2.27
SME1Q12330 PRE4YFR050C 801 nt0.9□□□□□ -2.27
SME1Q12330 YGR045CYGR045C 363 nt0.9□□□□□ -2.27
SME1Q12330 RPS27AYKL156W 249 nt0.9□□□□□ -2.27
SME1Q12330 YCS4YLR272C 3531 nt0.9□□□□□ -2.27
SME1Q12330 SPT7YBR081C 3999 nt0.89□□□□□ -2.27
SME1Q12330 YGR290WYGR290W 444 nt0.89□□□□□ -2.27
SME1Q12330 YHR130CYHR130C 336 nt0.89□□□□□ -2.27
SME1Q12330 EFR3YMR212C 2349 nt0.89□□□□□ -2.27
SME1Q12330 STO1YMR125W 2586 nt0.89□□□□□ -2.27
SME1Q12330 YNL122CYNL122C 348 nt0.88□□□□□ -2.27
SME1Q12330 IRC23YOR044W 474 nt0.88□□□□□ -2.27
SME1Q12330 NST1YNL091W 3723 nt0.88□□□□□ -2.27
SME1Q12330 LCD1YDR499W 2244 nt0.88□□□□□ -2.27
SME1Q12330 RRT1YBL048W 312 nt0.87□□□□□ -2.27
SME1Q12330 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.87□□□□□ -2.27
SME1Q12330 NUP192YJL039C 5052 nt0.87□□□□□ -2.27
SME1Q12330 SLD3YGL113W 2007 nt0.87□□□□□ -2.27
SME1Q12330 AIM9YER080W 1884 nt0.86□□□□□ -2.27
SME1Q12330 NPC2YDL046W 522 nt0.86□□□□□ -2.27
SME1Q12330 TIM13YGR181W 318 nt0.86□□□□□ -2.27
SME1Q12330 SAC3YDR159W 3906 nt0.85□□□□□ -2.27
SME1Q12330 BI2Q0110 1272 nt0.85□□□□□ -2.27
SME1Q12330 FYV7YLR068W 456 nt0.85□□□□□ -2.27
SME1Q12330 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.85□□□□□ -2.27
SME1Q12330 YBL071CYBL071C 309 nt0.85□□□□□ -2.27
SME1Q12330 ZEO1YOL109W 342 nt0.85□□□□□ -2.27
SME1Q12330 MMS4YBR098W 2076 nt0.85□□□□□ -2.27
SME1Q12330 PDE2YOR360C 1581 nt0.84□□□□□ -2.27
SME1Q12330 SLI15YBR156C 2097 nt0.84□□□□□ -2.27
SME1Q12330 WIP1YDR374W-A 270 nt0.84□□□□□ -2.27
SME1Q12330 ZIP2YGL249W 2115 nt0.84□□□□□ -2.27
SME1Q12330 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt0.84□□□□□ -2.27
SME1Q12330 snR189snR189 189 nt0.84□□□□□ -2.27
SME1Q12330 SPO75YLL005C 2607 nt0.84□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YDL206WYDL206W 2289 nt0.84□□□□□ -2.28
SME1Q12330 KAP120YPL125W 3099 nt0.83□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.83□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 88 ms