Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms