Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms