Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms