Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SETD1AO15047 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms