Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC69A6NI79 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms