Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms