Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA11Q9UKX5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms