Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms