Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRP68Q9UHB9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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