Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms