Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms