Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms