Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Batf3Q9D275 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Batf3Q9D275 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms