Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLVAPQ9BX97 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLVAPQ9BX97 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms