Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms