Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim8Q99PJ2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim8Q99PJ2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms