Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms