Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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Usp27Q8CEG8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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Usp27Q8CEG8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Usp27Q8CEG8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Usp27Q8CEG8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp27Q8CEG8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp27Q8CEG8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp27Q8CEG8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Usp27Q8CEG8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Usp27Q8CEG8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Usp27Q8CEG8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Usp27Q8CEG8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Usp27Q8CEG8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Usp27Q8CEG8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp27Q8CEG8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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Usp27Q8CEG8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Usp27Q8CEG8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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