Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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