Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF9Q00978 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms