Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms