Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms