Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa3P35173 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms