Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KNCNA6PVL3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms