Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHOC2Q9UQ13 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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