Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIAA1024Q9UPX6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms