Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1L1Q9UHC9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms