Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DKK3Q9UBP4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms