Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRBP1Q9P2E9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms