Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHRF1Q9P1Y6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms