Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms