Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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