Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms