Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACAP3Q96P50 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAP3Q96P50 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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